Fabia Combi wyposażona jest w nowoczesne jednostki napędowe. Silniki benzynowe i diesla, łącznie aż 10 do wyboru, w połączeniu z ręczną lub automatyczną skrzynią biegów, pracują cicho, sprawnie i zużywają niewiele paliwa.

Silniki benzynowe
Standardowa gama silników benzynowych obejmuje 6 jednostek. Są to sprawdzone silniki MPI: 1.2 (60 KM), 1.2 (70 KM), 1.4 16V (85 KM) oraz turbodoładowane jednostki TSI: 1.2 TSI (85 KM), 1.2 TSI (105 KM) oraz dostępny jedynie dla wersji RS, 1.4 TSI (180 KM). Wszystkie silniki benzynowe, jak i jednostki diesla spełniają europejskie normy emisji spalin EU5.

Silniki diesla
Paleta jednostek diesla oferowanych dla Fabii Combi obejmuje 4 silniki: trzycylindrowy 1.2 TDI CR o mocy 75 KM, czterocylindrowy 1.6 TDI CR w trzech wariantach mocy:
75 KM, 90 KM i 105 KM. Wszystkie silniki diesla wykorzystują technologię wtrysku paliwa common rail i są wyposażone w filtr cząsteczek stałych DPF.

Ręczna skrzynia biegów
Dla wszystkich wersji silnikowych dostępna jest ręczna, pięciobiegowa przekładnia, która zapewnia płynną i lekką zmianę przełożeń.

Automatyczna skrzynia biegów
Dla wersji silnikowej 1.2 TSI (105 KM) oraz 1.4 TSI (180 KM) dostępna jest automatyczna siedmiobiegowa dwusprzęgłowa przekładnia DSG (Direct Shift Gearbox), która gwarantuje komfortową i jednocześnie dynamiczną jazdę.